İddianamenin kabulünden sonra, yargılamanın alt dereceli bir mahkemeye ait olduğu gerekçesiyle görevsizlik kararı verilemeyeceğini, buna CMK'nın 6. maddesi hükmünün engel olduğunu yukarıda belirtmiştik.
CMK'nın 6. maddesi ile, 5. maddenin birinci fıkrasında yer alan ilkeye bir istisna getirilmektedir. Kanunun temel amaçlarından birisi, adil yargılama esas olmakla beraber, davaların sür'atle sonuçlandırılması olduğundan CMK 175. maddesine göre iddianamenin kabulü kararı verildikten sonra, suçun yargılamasının madde itibarıyla alt dereceli bir mahkemenin yetkisinde olduğundan söz edilerek görevsizlik kararı verilemeyecek, madde itibarıyla yüksek dereceli mahkeme artık yargılamayı sürdürerek kovuşturma evresindeki işlemleri gerçekleştirerek davayı hükme ulaştıracaktır. Doğal olarak, iddianamenin iadesine bu nedenle karar verildiğinde görevli mahkeme de gösterilecektir.
Üst dereceli mahkeme, bir işin mahkemeye gönderilmesi sırasında, suçun iddianamedeki nitelemesine göre daha alt dereceli bir mahkemeye ait olduğunun açıkça anlaşıldığı hallerde iddianamenin iadesine karar vermelidir. Ancak mahkemenin, iadeye karar vermemesi ve kabulü halinde, bu aşamadan sonra yargılama görevinin alt dereceli bir mahkemeye ait olduğu gerekçesiyle görevsizlik kararı veremeyecektir.
Üst dereceli mahkemenin, iddianameyi kabulünden sonra görev konusunda bir yanlışlık olduğunu fark etmesi ya da suçun niteliğinin duruşma aşamasında değişmesi durumunda davaya bakmaya devamla yükümlü tutulması, bir diğer deyişle, işi alt dereceli mahkemeye gönderme yasağının nedeni, üst dereceli mahkemenin daima alt dereceli mahkemeden daha güvenli kabul edilmesidir.
Özel ve genel görevli mahkemeler arasında, alt ya da üst dereceli mahkeme i-lişkisi yoktur. Ancak CMK'nın 252/1-g maddesi uyarınca, CMK'nın 6. maddesinde öngörülen kural, 250/1. maddede öngörülen "Türk Ceza Kanununda yer alan;
CMK'nın 9. maddesi uyarınca bağlantılı suçlardan her biri değişik mahkemelerin görevine giriyorsa, bunlar hakkında birleştirilmek suretiyle yüksek görevli mahkemede dava açılabilir. CMK'nın 10/1. maddesine göre kovuşturma evresinin her aşamasında, bağlantılı ceza davalarının birleştirilmesine veya ayrılmasına yüksek görevli mahkemece karar verilebilir ise de ayrılmasına karar verilen davanın daha alt görevli mahkemeye gönderilmesine CMK'nın 6. maddesi engel oluşturur.